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多参数 logistic 方程的 Liapunov 指数分布与图及其在 DNA 与 RNA 序列中的应用

生物物理 2025-05-06 v1 计算物理 生物大分子

摘要

多参数 logistic 方程此前已用于确定三进制代码的全局稳定性,基于代码中不同符号的排列方式。该方法已扩展到 DNA 与 RNA 序列,提出了特定于 DNA 复制和 RNA 中介蛋白密码构成过程中阅读与翻译过程的应用。为解决将 Liapunov 指数映射到四个代表不同核苷酸碱基的参数的复杂性,已开发出专门的技术。这些包括整个序列的 Liapunov 指数分布,以及将核苷酸碱基基于其化学类型(嘌呤式或嘧啶式)分类的二进制图。此类方法为检查基因组 material 的结构与功能属性提供了框架。所分析的序列涵盖广泛的 DNA 与 RNA 类型,包括含有和不含外显子的序列,以及编码和非编码区域。这种多层次方法提供了有价值的见解,以深化对核苷酸排列稳定性及其支配基因复制和蛋白质合成底层过程的理解。

关键词

引用

@article{arxiv.2505.02276,
  title  = {Liapunov exponent distributions and maps for multiple parameter logistic equation. Application to DNA and RNA sequences},
  author = {Miguel Martin-Landrove and B. P. Embaid},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2505.02276},
  year   = {2025}
}

备注

4 pages, 4 figures