通过数值判别法分解生物网络的参数空间
分子网络
2016-04-13 v1 代数几何
动力系统
数值分析
摘要
生物学、物理学和工程中的许多系统可用含多参数的常微分方程组描述。研究这些大型非线性系统的动态行为时，随着模型参数变化辨识并刻画稳态解是有用的，这是高维参数景观中技术上具挑战的问题。我们并非简单确定参数空间不同点处稳态的数量与稳定性，而是将参数空间分解为有限多个区域，每个区域内稳态解保持一致。从计算代数视角，这些区域的边界包含于判别簇（discriminant locus）中。我们开发了用于构造判别簇并分类参数景观的全局与局部数值算法。我们通过将数值方法应用于分子与细胞网络模型来展示其效果。
引用
@article{arxiv.1604.02623,
title = {Decomposing the parameter space of biological networks via a numerical discriminant approach},
author = {Heather A. Harrington and Dhagash Mehta and Helen M. Byrne and Jonathan D. Hauenstein},
journal= {arXiv preprint arXiv:1604.02623},
year = {2016}
}
备注
13 pages, 4 figures