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随机反应网络中约束稳态分布参数区域的代数计算方法

分子网络 2019-04-19 v4 生物物理

摘要

稳态是反应网络中的基本概念。其稳定性反映了细胞信号转导与基因表达等多种生物现象的根本特征。由于生化反应发生于细胞层面,其受到不可避免涨落的影响。尽管已有若干方法用于检测和分析确定性模型稳态的稳定性,这些方法无法应用于随机反应网络。本文提出一种基于代数计算的算法,用于计算随机反应网络约束稳态分布的参数区域,其中均值与方差满足给定不等式约束。为评估所提方法,我们对三种典型化学反应进行计算机仿真,并证明该方法所得结果与仿真结果一致。

关键词

引用

@article{arxiv.1802.09169,
  title  = {An algebraic method to calculate parameter regions for constrained steady-state distribution in stochastic reaction networks},
  author = {Tan Van Vu and Yoshihiko Hasegawa},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1802.09169},
  year   = {2019}
}

备注

17 pages, 4 figures