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随机化学反应稳态矩分析的凸优化方法

分子网络 2018-08-07 v2 系统与控制

摘要

基于模型的生物分子反应随机噪声预测常常借助精度未知的近似。因此,意外的随机涨落令生物分子电路设计者头疼。本文提出一种凸优化方法,以理论严谨性量化分子拷贝数的稳态矩。我们证明随机矩位于由线性矩阵不等式指定的凸半代数集中。因此,某些矩的上下界可通过半定规划计算。以蛋白质二聚化过程为例,我们展示了所提方法能精确预测单体蛋白拷贝数的均值与方差。

关键词

引用

@article{arxiv.1704.07722,
  title  = {A Convex Approach to Steady State Moment Analysis for Stochastic Chemical Reactions},
  author = {Yuta Sakurai and Yutaka Hori},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1704.07722},
  year   = {2018}
}