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计数具有少量网状顶点的系统发生网络:精确枚举与修正

组合数学 2021-03-05 v2

摘要

在先前的工作中,我们给出了具有kk个网状顶点的树子网络与正常网络数量的渐近计数结果,以及k=1,2,3k=1,2,3时计数序列的显式指数生成函数。本注记的目的有二。首先,我们对先前的方法作出若干修正,该方法高估了上述数量并因此给出了错误的指数生成函数(然而,高估并不影响我们的渐近计数结果)。其次,我们利用(修正后的)指数生成函数推导具有k=1,2,3k=1,2,3个网状顶点的树子网络与正常网络数量的显式公式。这重新推导了Carona与Zhang近期的结果,回答了他们关于k=2k=2时正常网络的问题,并补充了k=3k=3情形下的新公式。

关键词

引用

@article{arxiv.2006.15784,
  title  = {Counting Phylogenetic Networks with Few Reticulation Vertices: Exact Enumeration and Corrections},
  author = {Michael Fuchs and Bernhard Gittenberger and Marefatollah Mansouri},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2006.15784},
  year   = {2021}
}

备注

revised version; 20 pages