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计数具有少量网状顶点的系统发育网络:树-子网络与正规网络

组合数学 2018-11-13 v3

摘要

近几十年来,系统发育网络已成为刻画演化过程的标准工具。然而,关于它们的基本组合问题在很大程度上仍是开放的。例如,即便是系统发育网络及其子类的渐近计数问题也尚未解决。本文中,我们提出一种基于生成函数的方法,对两类在应用中十分重要的子类——树-子网络与正规网络——计数具有少量网状顶点的网络。特别地,当网状顶点数固定且网络规模趋于无穷时,我们的方法可用于完全解决这些网络类的渐近计数问题。

关键词

引用

@article{arxiv.1803.11325,
  title  = {Counting Phylogenetic Networks with Few Reticulation Vertices: Tree-Child and Normal Networks},
  author = {Michael Fuchs and Bernhard Gittenberger and Marefatollah Mansouri},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1803.11325},
  year   = {2018}
}

备注

second revision of our previous submission; 28 pages