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Logistic 双基因遗传振荡器中的持续极限环:基于延迟驱动的 Hopf 分岔

动力系统 2026-05-25 v1

摘要

Logistic 双基因负反馈振荡器由于雅可比迹始终为负,因此对所有生物学参数值都具有局部渐近稳定性。然而,实际生物振荡器(昼夜节律、段肌时钟、Hes1、p53)都依赖于延迟。我们将 logistic 双基因模型扩展为具有转录延迟 τ1\tau_1τ2\tau_2 的延迟微分方程系统,证明当总延迟 τ=τ1+τ2\tau=\tau_1+\tau_2 跨越显式临界值 τc\tau_c 时,平衡点通过 Hopf 分岔失去稳定性。Hopf 频率 ωc\omega_cτc\tau_c 由 logistic 导数以闭式计算;环路增益条件 AB>γ1γ2AB>\gamma_1\gamma_2 为必要且充分条件;转移性 Re(dμ/dτ)τc>0\mathrm{Re}(d\mu/d\tau)|_{\tau_c}>0 具有参数一致的正下界;且分岔在全局上持续存在。延迟之和对称性将分析简化为标量参数 τ\tau。数值仿真确认三种模式(阻尼、小极限环、松弛),超临界幅值标度 AcττcA\sim c\sqrt{\tau-\tau_c},以及深松弛周期渐近 T2τ+CT\sim 2\tau+C_\infty,其中闭式偏移 CC_\infty 给出。对于对称阈值回路,超临界性通过 Lindstedt--Poincaré 约化给出闭式幅值和频率公式;对于一般非对称回路,提供闭式第一个 Lyapunov 系数和显式临界性准则。根据 p53--Mdm2 数据校准,闭式 Hopf 周期与观察到的振荡相差不足 3%,而标准 Hill 函数模型则在几百个百分点内。该分析推广至循环 NN 基因回路,给出每个 NN 有效的闭式转移率,并在对称情况下给出显式延迟诱导 Hopf 窗口 γN<Λ<γNsecN(π/N)\gamma^N<\Lambda<\gamma^N\sec^N(\pi/N)

关键词

引用

@article{arxiv.2605.23722,
  title  = {Sustained Limit Cycles in the Logistic Two-Gene Genetic Oscillator: A Delay-Driven Hopf Bifurcation},
  author = {Ismail Belgacem},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2605.23722},
  year   = {2026}
}