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虫状系统发育网络中3,4-叶幂图的结构与多项式时间识别

离散数学 2015-03-17 v4 定量方法

摘要

如果图GG的顶点是树TT的叶子,且两个顶点在TT中相邻当且仅当它们在TT中的距离至多为kk,则称GG是树TTkk-叶幂图,TTGGkk-叶根。该概念由Nishimura、Ragde和Thilikos [2002]提出,其动机是寻找潜在的系统发育树。本文研究了kk-叶幂图识别问题的扩展,该扩展源于评估病毒群体中基因水平转移的新生物学问题。我们允许宿主图与树略有偏差,并允许存在一些环。具体而言,我们研究了环两两顶点不相交的虫状系统发育网络。我们展示了一些结构结果,并为k=3k=3k=4k=4的情况提出了多项式算法。作为推论,虫状网络的平方图也可以在多项式时间内被识别。

关键词

引用

@article{arxiv.1012.4084,
  title  = {Structure and Recognition of 3,4-leaf Powers of Galled Phylogenetic Networks in Polynomial Time},
  author = {Michel Habib and Thu-Hien To},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1012.4084},
  year   = {2015}
}