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化学反应网络的符号模式

动力系统 2011-04-19 v1

摘要

化学反应网络(CRN)中的大多数微分方程具有形式 dx/dt=f(x)=Sv(x)dx/dt=f(x)= Sv(x),其中 xx 位于非负象限,SS 是一个实矩阵(化学计量矩阵),vv 是一个由与 SS 具有特殊关系的实值函数组成的列向量。我们的主要兴趣在于 f(x)f(x) 的雅可比矩阵 f(x)f'(x),特别是每个元素 f(x)ijf'(x)_{ij} 在象限内对所有 xx 是否具有相同的符号,即雅可比矩阵遵循一个符号模式。换句话说,物种 xjx_j 总是以抑制方式作用于物种 xix_i,或者其作用总是兴奋性的。在 Helton、Klep、Gomez 的工作中,我们给出了自然与 SS 相关的物种-反应图上保证关联 CRN 的雅可比矩阵具有符号模式的充分必要条件。在本文中,给定 SS,我们给出了一种构造,该构造向 SS 添加某些行和列,从而产生一个对应于具有一些添加物种和反应的新 CRN 的化学计量矩阵 S^\widehat S。基于 S^\hat S 的该 CRN 的雅可比矩阵具有符号模式。基于 SS 和基于 S^\hat S 的 CRN 的平衡点之间存在一一对应关系,其中原始 CRN 的每个平衡点 ee 是通过从新 CRN 的平衡点 e^\hat e 中移除其添加的物种而得到的。在我们的新 CRN 构造中,我们可以选择添加反应的速率常数,并且如果我们将它们选择得足够大,那么当且仅当平衡点 ee 是局部渐近稳定时,平衡点 e^\hat e 才是局部渐近稳定的。还展示了该构造的进一步性质,例如与守恒量以及两个 CRN 的缺陷度比较相关的性质。

关键词

引用

@article{arxiv.0904.2960,
  title  = {Sign patterns for chemical reaction networks},
  author = {J. William Helton and Igor Klep and Vitaly Katsnelson},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0904.2960},
  year   = {2011}
}

备注

23 pages