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具有一般动力学的化学反应网络的反应分解与复平衡分布

概率论 2025-08-14 v5 分子网络

摘要

从流行病学、种群生物学到遗传学和细胞生物学,反应网络已成为生物科学中的主要建模框架。近年来,随机反应网络(SRNs)——建模为连续时间马尔可夫链(CTMCs)——及其平稳分布取得了诸多进展。我们关注复平衡平稳分布,其中流出某复的概率流等于流入该复的流。我们通过反应图(有向图)的圈上条件,刻画了具有任意转移函数的 SRNs 的复平衡分布的存在性与形式。此外,我们给出了复平衡分布存在的充分条件,并给出了其同时为必要条件时的精确条件。该充分条件对于质量作用动力学(及其某些推广)或当该有向图的连通分支为圈时也是必要的。进而,我们陈述了一个亏缺定理,它是随机质量作用动力学亏缺定理到任意随机动力学的推广。该定理给出了存在复平衡分布时的参数空间的余维数。为此,我们构造了一种迭代过程,将强连通反应图分解为不相交的圈,使得对应的 SRN 具有等价动力学并在原 SRN 具有复平衡性时保持该性质。此分解可能具有独立意义,并可能适用于一般的边标记有向图。

关键词

引用

@article{arxiv.2301.04091,
  title  = {Reaction cleaving and complex-balanced distributions for chemical reaction networks with general kinetics},
  author = {Linard Hoessly and Carsten Wiuf and Panqiu Xia},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2301.04091},
  year   = {2025}
}

备注

31 pages, 2 figures