核小体定位与能量学：基因组与计算研究的最新进展

染色质是由DNA、RNA和蛋白质组成的复合物，其主要功能是将基因组DNA包装到细胞核的紧密空间内。染色质的一个基本重复单元是核小体，它由组蛋白八聚体组成，约147个碱基对的DNA以左旋超螺旋缠绕近两圈。染色质是一种动态结构，对基因表达调控及其他细胞功能具有深远影响。这些染色质介导的过程通过优化整个基因组中的核小体位置，以及响应各种外部和内部信号（如环境扰动）对核小体进行重塑来实现。本文讨论了通过并行高通量测序和微阵列技术的最新进展获得的大规模核小体位置图谱。我们展示了这些图谱揭示了真核生物基因组中核小体组织的共同特征。我们还综述了旨在预测核小体形成分数或能量的计算模型，并演示了如何利用这些预测在基因组上定位多个核小体而避免空间重叠。