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差分交联与收缩马达驱动核染色质压缩

软凝聚态物质 2025-07-25 v1 生物物理

摘要

在细胞核的间期期间,典型的细胞核特征为染色质活性组的空间分区化——紫顶染色质位于核内,而抑制性异染色质则位于核周围。异染色质约比紫顶染色质密度高 50%。在传统的核组织模型中,紫顶染色质主要位于核内部,而异染色质则位于核周围。核周围染色质组织可进一步由核膜调节,而核膜本身即为可变形的结构。尽管已探索许多刚性核内的 compartments 化机制,但本文研究由交联聚合物构成的染色质模型,其连接至可变形聚合物壳体的核膜。收缩马达、壳体的可变形性以及交联位置的空间分布在该 compartments 化中均发挥关键作用。我们发现,即使在核边缘存在较小的线性交联密度差异,若交联呈径向分布,结合收缩马达活性,仍可驱动基因组分离,这与实验观察一致。这源于收缩马达优先将交联拉向自身近处,在核周围形成高密度域,从而促进异染色质形成。我们还发现,鞘状纤维以下的优先异染色质压缩会增加核皱褶的刚性,这与在施加纳米压迫下的瞬时核刚性硬化相符。我们以潜在的实验验证模型预测为结论。

关键词

引用

@article{arxiv.2507.17883,
  title  = {Differential Crosslinking and Contractile Motors Drive Nuclear Chromatin Compaction},
  author = {Ligesh Theeyancheri and Edward J. Banigan and J. M. Schwarz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2507.17883},
  year   = {2025}
}

备注

18 pages, 7 figures, and Supporting information