单核小体动力学揭示的快与慢染色质组织
软凝聚态物质
2022-10-12 v1 无序系统与神经网络
生物物理
亚细胞过程
摘要
理解染色质组织与动力学十分重要，因为它们关键地影响 DNA 功能。在本研究中，我们通过统计分析了活人类细胞中单核小体运动来探究染色质动力学。核小体均方位移分布的双峰性质使得可将核小体自然归类为快与慢两类。对这些类别内核小体-核小体关联函数以及振动模式密度的分析表明，核小体形成了动态关联流体区域，即快与慢核小体的动态域。通过全局组蛋白乙酰化或黏连蛋白失活扰动核小体动力学表明，核小体-核小体相互作用以及染色质链的锚定将核小体组织为快与慢动态域。我们引入了一个简单聚合物模型，其显示了该动态域图像的一致性。单核小体运动的统计分析提供了关于活细胞中染色质如何以流体方式动态组织的丰富信息。
引用
@article{arxiv.1908.05851,
title = {Organization of fast and slow chromatin revealed by single-nucleosome dynamics},
author = {S. S. Ashwin and Tadasu Nozaki and Kazuhiro Maeshima and Masaki Sasai},
journal= {arXiv preprint arXiv:1908.05851},
year = {2022}
}