关于二核小体解缠绕的深入解析
生物大分子
2020-01-28 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
核小体作为染色质的构建模块，其动力学对真核生物基因组的表达、复制和修复具有关键影响。除了核小体因热涨落而产生的持续运动外，ATP依赖的染色质重塑复合物会引起其主动位移。在此，我们提出一种在外力作用下二核小体缠绕与解缠绕动力学的理论分析。我们探索了二核小体在不同解缠绕状态下的能量景观与构型。此外，利用动态蒙特卡洛模拟算法，我们展示了系统的动力学特征，例如部分与完全缠绕过程的解缠绕力。进而，我们表明在较短的连接DNA长度（ bp）下，会发生不对称解缠绕。这些发现有助于阐明染色质动力学与基因可及性。
引用
@article{arxiv.2001.09411,
title = {Insight into the Unwrapping of the Dinucleosome},
author = {Fatemeh Khodabandeh and Hashem Fatemi and Farshid Mohammad-Rafiee1},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.09411},
year = {2020}
}