张力依赖的核小体解缠绕自由能

核小体构成真核生物基因组内压缩的基本单元，其位置是基因调控中一个重要但理解甚少的机制。量化核小体内部相互作用的强度是生物物理学的一个核心问题，对于理解核小体位置如何影响基因表达至关重要。通过与单分子实验比较，我们证明核小体的粗粒化分子模型能够重现核小体解缠绕的关键特征。利用对DNA和组蛋白的详细模拟，我们计算了对应于解缠绕过程的张力依赖自由能面。该模型定量重现了解开核小体所需的力，并揭示了静电相互作用在此过程中所起的作用。我们随后证明，组蛋白修饰和DNA序列可对核小体形成的能量产生显著影响。最值得注意的是，我们表明组蛋白尾部对于稳定核小体DNA的外圈至关重要。