DNA上核小体定位的条件

核小体沿真核基因组定位在其组织和调控中起重要作用。有许多不同因素影响核小体的位置。一些可视为单个核小体沿 DNA 不同位置的优先结合，一些可视为相邻核小体之间的相互作用。在本研究中，我们分析了核小体沿 DNA 的定位良好程度如何作为优先结合强度、结合能景观的关联长度、相邻核小体之间的相互作用以及其他相关系统性质的函数。我们分析了不同情景：设计的能景观和一般无序的能景观，并推导了良好定位的条件。使用解析和数值方法，我们发现，即使结合偏好非常弱，相互作用与结合偏好之间的协同相互作用对于核小体的良好定位至关重要，特别是在相关联的能景观上。通过分析经验能景观，我们讨论了我们的理论结果与 DNA \emph{in vivo} 上核小体定位的相关性。