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核小体的尺寸

生物物理 2015-03-18 v2 软凝聚态物质 生物大分子

摘要

本文探讨了11 nm核小体盘尺寸的结构起源。在纳米尺度上,DNA在染色体中作为染色质的组织涉及DNA绕核小体组蛋白核心的缠绕。我们提出,核小体核心颗粒的尺寸由满足两个标准决定:一是优化DNA双螺旋的体积分数;这种紧密堆积的要求源于优化原子和分子相互作用。另一个标准是零应变-扭转耦合;在DNA重组过程中(例如核小体沿DNA双螺旋重新定位或滑动)允许瞬态拉伸应力时,零扭转结构是必要的。我们应用的数学模型基于假设硬壁的双螺旋管状描述。当包含连接DNA的碱基对时,理想核小体尺寸的估计与实验数值非常吻合。有趣的是,核小体的尺寸被证明是DNA双螺旋内在特性的结果。

关键词

引用

@article{arxiv.1102.0761,
  title  = {The size of the nucleosome},
  author = {Jakob Bohr and Kasper Olsen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1102.0761},
  year   = {2015}
}

备注

11 pages, 5 figures; v2: minor modifications