真核基因组的染色质组织：序列特异性 + 统计学=组合性（扩展摘要）

真核基因组中的核小体组织对基因功能有着深远影响。尽管最近在识别影响核小体定位的各种竞争因素方面取得了进展，但核小体位置是由序列决定还是由随机过程确定仍不清楚。长期以来人们推测，在转录起始位点 (TSS) 附近，存在一个屏障决定了 +1 核小体的位置，随后几何约束改变了随机定位过程，从而确定了核小体的相位排列。这种模式随着远离屏障而逐渐消失，再次变为随机定位过程。虽然这一统计模型被广泛接受，但该屏障的分子本质仍然未知。此外，我们远未找到一套能够解释全基因组核小体组织、阐明统计机制所依赖的屏障本质、并允许从序列决定定位到统计定位及其反向过程平滑过渡的序列规则。我们表明，通过各种方法量化的序列复杂性，可以是至少部分解释上述所有现象的规则。特别地，我们对四种模式真核生物的高分辨率核小体图谱进行了分析，发现可以通过序列复杂性度量很好地区分核小体缺失区和核小体富集区。具体而言，(a) 缺失区的复杂性低于富集区；(b) 在 TSS 周围，仅凭复杂性测量就与体内核小体占据率惊人地一致，特别是精确指出了 +1 和 -1 核小体的位置。这些发现表明，序列内子序列的内在丰富度在基因组核小体形成中发挥作用，且序列复杂性构成了核小体屏障的分子本质。