染色质纤维如何应对拓扑约束?
亚细胞过程
2007-05-23 v2 软凝聚态物质
生物物理
摘要
在真核细胞核中,DNA通过若干层级的压缩以有序可检索的方式包装,从而实现基因表达的正确调控。该组装的功能动力学涉及所谓30 nm染色质纤维的解绕,并由此施加强烈的拓扑约束。我们提出一种计算任意缠绕模式的扭转(twist)与环绕(writhe)的通用方法。针对染色质纤维给出了显式推导,提供了真核染色体中DNA的连接数(linking number)。我们证明存在唯一一条解绕路径,同时满足DNA在凝聚/解凝聚过程中必须应对的拓扑与力学约束。
引用
@article{arxiv.q-bio/0404037,
title = {How does the chromatin fiber deal with topological constraints?},
author = {Maria Barbi and Julien Mozziconacci and Jean-Marc Victor},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0404037},
year = {2007}
}
备注
Presented in Nature "News and views in brief" Vol. 429 (13 May 2004). Movies available at http://www.lptl.jussieu.fr/recherche/operationE_fichiers/Page_figurePRL.html