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染色质纤维的自适应弹性特性

统计力学 2016-08-16 v2 软凝聚态物质 生物大分子

摘要

染色质是由 DNA 与特定蛋白组成的复杂体,位于真核基因组的双链 DNA 与染色体之间。于构建染色质装配的通用模型,我们探讨了染色纤维的机械性质与其生物功能之间的相互作用。一个量化步骤是将 DNA 层面的力学特性与在染色纤维层面上描述的力学特性联系起来。这使得我们能够以 DNA 弹性特性和纤维几何特征为参数,计算出染色质的完整弹性常数集合(扭转与弯曲持久长度、拉伸模量及扭转-拉伸耦合常数)。这些弹性常数对纤维的局部结构高度敏感,我们认为这种可调节的弹性特性可能是染色质功能的关键特征,例如在转录的启动与调控中。此外,这一分析提供了解释染色纤维微操作实验的框架,并建议进一步进行涉及拮抗剂的实验,以扫描纤维的可调弹性。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0211176,
  title  = {Adaptive elastic properties of chromatin fiber},
  author = {Eli Ben-Haïm and Annick Lesne and Jean-Marc Victor},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0211176},
  year   = {2016}
}

备注

5 pages, 3 figures