DNA 力学性质的长度尺度依赖性
生物大分子
2015-06-11 v1
摘要
尽管 DNA 的力学性质在千碱基对范围内已得到良好表征，但最近的一些实验表明，DNA 在更短的长度尺度上更具柔性，这对应于 DNA 包装和基因调控等细胞过程至关重要的区域。在此，我们利用原子模拟的轨迹，从单个碱基对水平探测到四个螺旋圈，系统研究了不同长度尺度下 DNA 的有效弹性性质。我们发现了支持拉伸模量协同软化的证据，并确定了产生这种效应的本质模式。弯曲相关性表现出反映螺旋周期性的调制，同时给出了有效持久长度的合理值，而扭转模量在半个 DNA 圈范围内经历了平滑的交叉——从单个碱基对水平的相对较小值过渡到体相值。
引用
@article{arxiv.1210.7205,
title = {Length scale dependence of DNA mechanical properties},
author = {Agnes Noy and Ramin Golestanian},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.7205},
year = {2015}
}
备注
5 pages, 4 figures, accepted for publication in Phys. Rev. Lett