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对“DNA力学性质的长度尺度依赖性”的评论

生物大分子 2013-11-12 v2

摘要

最近的实验数据表明,在长尺度上表现良好的DNA弹性蠕虫杆模型可能在生物学相关的较短尺度上失效。根据Noy和Golestanian(Phys. Rev. Lett. 109, 228101, 2012)的说法,分子动力学(MD)模拟预测的DNA刚性接近实验数据,并证实了这种失效的一种情景,即对于几个螺旋圈的长度,DNA动力学表现出长程弯曲和拉伸相关性。使用类似力场的早期研究得出结论:(i)MD系统性地高估了DNA刚性,以及(ii)未检测到与WLR模型的偏差。本文认为上述论文中的数据分析是不正确的,并且早期的结论是有效的。

关键词

引用

@article{arxiv.1212.4733,
  title  = {Comments on "Length scale dependence of DNA mechanical properties"},
  author = {Alexey K. Mazur},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1212.4733},
  year   = {2013}
}

备注

Revised version to appear in Phys. Rev. Lett