自由空间中沿链轮廓具有可变弯曲刚度的蠕虫状链力学行为
生物物理
2019-11-05 v2 软凝聚态物质
摘要
本文提出一种理论，用于高效处理自由空间中异质聚合物链的力学性质，其核心问题是在沿链轮廓持续长度（弯曲刚度的度量）变化条件下，求解扩散方程与取向-取向关联函数。此外，我们给出测量可变持续长度的具体实验方法以检验理论。为验证理论预测，我们还基于广义珠-杆（GBR）模型进行了大量布朗动力学模拟，结果表明理论与模拟吻合良好。作为应用，我们成功分析了DNA链力学行为的序列依赖性，并给出了基本二核苷酸步的确切持续长度，其通过使用基本步设计其他DNA片段得到验证。
引用
@article{arxiv.1910.13745,
title = {Mechanical behavior of a wormlike chain with variable bending rigidity along the chain contour in free space},
author = {Ming Li and Jizeng Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1910.13745},
year = {2019}
}
备注
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