交错螺旋 DNA 的弹性与静电学
生物大分子
2015-05-13 v1
摘要
我们提出了一种用于单分子实验中 DNA 力学响应的自洽理论。我们的模型基于 DNA 分子的一维连续介质描述，同时考虑了其弹性以及 DNA-DNA 静电相互作用。我们考虑了实验中使用的经典加载几何结构，其中分子的一端附着在基底上，另一端被拉力拉伸并扭转给定的圈数。我们关注与大圈数极限相关的构型，这些构型由两相组成，一相为线性 DNA，另一相为超螺旋 DNA。该模型考虑了线性相中的热涨落和超螺旋相中的静电相互作用。预测了扭转应力、超螺旋半径和角度的值，以及实验伸长-旋转曲线的关键特征，即线性区域的斜率和热屈曲阈值。发现它们与实验数据吻合良好。
引用
@article{arxiv.0811.1840,
title = {Elasticity and electrostatics of plectonemic DNA},
author = {N. Clauvelin and B. Audoly and S. Neukirch},
journal= {arXiv preprint arXiv:0811.1840},
year = {2015}
}
备注
19 pages and 6 figures