超螺旋 DNA 中存在螺线管相的证据

Andrew Dittmore; Keir C. Neuman

超螺旋 DNA 中存在螺线管相的证据

生物物理 2018-04-23 v1 软凝聚态物质生物大分子

作者: Andrew Dittmore , Keir C. Neuman

摘要

在力学操控实验中，在恒定力下被过缠绕的单条 DNA 分子在屈曲并形成超螺旋环（plectoneme）时，其伸展长度会发生不连续的下降。进一步过缠绕 DNA 时，我们观察到与 plectoneme 逐步伸长相关的一连串高度规则的不连续伸展变化。这一现象与一个模型相符，其中力拉伸的 DNA 由于拓扑 writhe 而形成阻碍 plectoneme 伸长的屏障。此外，在涨落的螺线管中考虑 writhe，可改进对测得的力依赖的 DNA 有效扭转模量的描述，从而提供估计 DNA 扭矩的可靠公式。因此，我们的数据和模型为进一步捕捉超螺旋生物聚合物的结构与力学的测量和理论提供了背景。

关键词

超螺旋 DNA 螺线管相 plectoneme writhe 扭转模量 DNA 扭矩生物聚合物力学

引用

@article{arxiv.1804.06442,
  title  = {Evidence for a Solenoid Phase of Supercoiled DNA},
  author = {Andrew Dittmore and Keir C. Neuman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1804.06442},
  year   = {2018}
}

备注

See https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2018/04/16/302661.DC1/302661-1.pdf for supporting information and https://drive.google.com/open?id=1sd6j4P-lYrZpgPbPAA1N8z2yWG2kLeQT for code

超螺旋 DNA 中存在螺线管相的证据

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