DNA中多螺线体相的统计力学

一条被拉伸同时处于欠旋或过旋状态的DNA分子会经历屈曲转变，形成相互缠绕的环状结构域，称为多螺线体（plectonemes）。此处我们发展了一个简单理论，扩展了拉伸超螺旋DNA的两相模型，通过引入位置熵和长度分布熵，允许多个螺线体域共存。这种多螺线体相在长DNA分子中更有利，因为位置熵的增加补偿了沿拉伸DNA片段成核一个螺线体的代价。尽管理论简单，但该理论与可扭转蠕虫链模型的蒙特卡洛模拟结果吻合良好。理论预测的螺线体数量多于实验观测值，我们将其归因于实验数据分辨率的有限。由于螺线体通过荧光信号探测，低于可观测阈值的较短螺线体很可能被遗漏。