序列依赖性刚度对dsDNA中超螺旋环定位的影响
软凝聚态物质
2015-01-05 v1 生物物理
生物大分子
摘要
我们使用蒙特卡洛模拟研究可变刚度对超螺旋dsDNA中超螺旋环形成与定位的影响。我们表明软序列的存在增加了超螺旋环分支的数量，且分支的边缘倾向于定位在这些序列处。我们提出了一种在体外测试我们结果的实验方法，并讨论了超螺旋环定位在转录因子搜索细菌基因组上其靶标（启动子区域）过程中可能起的作用。
引用
@article{arxiv.1501.00106,
title = {Effect of Sequence-Dependent Rigidity on Plectoneme Localization in dsDNA},
author = {Shlomi Medalion and Yitzhak Rabin},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.00106},
year = {2015}
}