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成环DNA的状态方程

生物大分子 2007-05-23 v1

摘要

我们计算DNA在受张力且具环情况下的状态方程。此类环在存在多价离子或滑动阳离子蛋白连接子时DNA缩合过程中瞬时出现。将此类成环DNA建模为蠕虫状链,其在半经典极限下通过路径积分计算力-伸展关系。这使我们严格确定高拉伸渐近行为。值得注意的是,力-伸展曲线的函数形式与直DNA相似,但表观持久长度被强烈重正化。这意味着实验提取的单分子弹性不一定仅反映裸DNA刚度,还可包含依赖于整体链构象与长度的额外贡献。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0509003,
  title  = {Equation of state of looped DNA},
  author = {I. M. Kulic and H. Mohrbach and R. Thaokar and H. Schiessel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0509003},
  year   = {2007}
}

备注

28 pages, 4 figures, submitted