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缆索动力学在DNA长尺度力学中的应用

生物物理 2007-05-23 v1 化学物理 计算物理

摘要

本文介绍了使用缆索动力学模型作为探索DNA长尺度力学的工具。正是在这些长度尺度上,DNA形成扭曲和弯曲的三维形状,称为超螺旋和环。这些长尺度DNA结构对该分子在细胞内的功能有显著影响,包括DNA在细胞核中的包装、转录、复制和基因修复。我们提供了DNA力学的简短背景,并提出了与低张力缆索力学的逻辑联系。然后总结了一个计算模型,并给出了DNA超螺旋和成环的示例结果。

关键词

引用

@article{arxiv.physics/0702197,
  title  = {Cable dynamics applied to long-length scale mechanics of DNA},
  author = {Sachin Goyal and Todd Lillian and Noel C. Perkins and Edgar Meyhofer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0702197},
  year   = {2007}
}

备注

14 pages, 7 figures, An invited keynote speech, in CD-ROM Proceedings of Sixth International Symposium on Cable Dynamics, Charleston, SC, 19-22 Sept, 2005