利用流体动力学在纳米通道中操纵 DNA 构象
生物物理
2014-09-02 v1 软凝聚态物质
摘要
在纳米流体器件中控制 DNA 伸长对于大规模基因组分析具有巨大潜力。迄今为止，纳米通道中的 DNA 操纵主要通过电泳进行，很少使用流体动力学，尽管过去十年中纳米尺度流动中的软物质物理学引起了相当大的兴趣。在本报告中，我们利用这两种驱动原理研究了 DNA 在横向尺寸为 100 至 500 nm 的纳米通道中的迁移。我们表明，使用流体动力学可使弛豫动力学减慢 3 倍，伸长率增加高达 3 倍。我们提出了一个模型来解释随流动产生的伸长起始，该模型假设 DNA 响应由通道壁邻近性介导的剪切驱动升力决定。总体而言，我们认为流体动力学驱动可以实现对纳米通道中 DNA 的改进操纵。
引用
@article{arxiv.1409.0373,
title = {Conformational Manipulation of DNA in Nanochannels Using Hydrodynamics},
author = {Qihao He and Hubert Ranchon and Pascal Carrivain and Yannick Viero and Joris Lacroix and Charline Blatché and Emmanuelle Daran and Jean-Marc Victor and Aurélien Bancaud},
journal= {arXiv preprint arXiv:1409.0373},
year = {2014}
}