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DNA 链电泳捕获进入纳米孔

生物物理 2013-06-20 v1 软凝聚态物质 生物大分子

摘要

基于我们对孔附近 DNA 电泳的表述 [P. Rowghanian and A. Y. Grosberg, Phys. Rev. E 87, 042723 (2013)],我们将电泳 DNA 捕获进入纳米孔视为粒子吸收至置于能垒顶部的汇的稳态过程。通过复现先前观察到的扩散限制和势垒限制机制作为粒子吸收过程的两个不同极限并拟合数据,我们的模型表明,对于非常大的 DNA 分子,捕获率随 DNA 长度的增长比先前模型预测的更慢,这激励了在当前电场和 DNA 长度范围之外进行更多实验。在中等弱电场下,我们的模型预测了一种不同的效应,指出随着电场减弱,捕获率对 DNA 长度的依赖性首先消失,最终转变为随 NN 减小的趋势。

关键词

引用

@article{arxiv.1306.4603,
  title  = {Electrophoretic Capture of a DNA Chain into a Nanopore},
  author = {Payam Rowghanian and Alexander Y. Grosberg},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1306.4603},
  year   = {2013}
}

备注

9 pages, 4 figures