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聚合物建模预测衰老过程中的染色体重组

生物物理 2020-10-20 v1 软凝聚态物质 亚细胞过程

摘要

lamina 相关结构域(LADs)覆盖人类基因组的很大一部分,并被认为在塑造核结构景观中发挥主要作用。在此,我们结合聚合物模拟、显微镜与质谱分析,以剖析异染色质与 lamina 介导的相互作用在核组织中所扮演的角色。我们的模型解释了生长细胞中异染色质与常染色质的常规组织方式,以及癌基因诱导衰老与早衰症中的病理性组织方式。我们表明,在衰老与早衰样细胞中实验观察到的接触局部性变化,可解释为系统中相变所导致。在我们的模拟中,LADs 具有高度随机性,与实验一致。我们的模型提示,一旦确立,衰老表型应是亚稳态的,即便恢复 lamina 介导的相互作用也是如此。总体而言,我们的模拟揭示了一种通用物理机制,可调控广泛哺乳动物细胞核中的异染色质分离与 LAD 形成。

关键词

引用

@article{arxiv.2010.09688,
  title  = {Polymer Modelling Predicts Chromosome Reorganisation in Senescence},
  author = {Michael Chiang and Davide Michieletto and Chris A. Brackley and Nattaphon Rattanavirotkul and Hisham Mohammed and Davide Marenduzzo and Tamir Chandra},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2010.09688},
  year   = {2020}
}

备注

20 pages, 8 figures