无序共聚物中自发域形成作为染色体结构化的一种机制
生物大分子
2018-02-13 v1
摘要
受染色体中域形成问题的启发，我们研究了一种共聚物模型，其中仅一部分单体感受到吸引相互作用。这些单体从规则间隔的模式中随机偏移，从而给系统引入一些淬灭无序。先前工作表明，在规则间隔相互作用单体的情况下，该链可折叠成以连续片段的多个不同域为特征的结构。在每个域中，吸引相互作用与形成环的熵代价相平衡。我们通过先进的副本交换模拟表明，在相互作用单体位置中加入无序进一步稳定了这些域。该模型提示，链划分为定义明确的连续单体域是杂聚物的一种自发属性。就染色体而言，进化可能已作用于相互作用单体的间距，以简单方式调节潜在域以满足功能需求。
引用
@article{arxiv.1802.03949,
title = {Spontaneous domain formation in disordered copolymers as a mechanism for chromosome structuring},
author = {Matteo Negri and Marco Gherardi and Guido Tiana and Marco Cosentino Lagomarsino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1802.03949},
year = {2018}
}