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均场杂聚物中序列选择与压缩耦合动力学

无序系统与神经网络 2007-05-23 v1 q-bio

摘要

我们研究了一个简可求解的模型,描述单肽序列(如蛋白质)单链构象发生 genesis 的机制,认为其源于功能性与结构可重复性这两项要求之间的竞争。由于可重复性以折叠过程的特性来定义,故需分析(快速)聚合物折叠与(慢速)基因序列选择之间的耦合动力学。针对本均场模型,采用有限维置换法进行分析,得到(一阶和二阶)相变的精确结果,并构建了丰富的相图。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0206277,
  title  = {Coupled dynamics of sequence selection and compactification in mean-field hetero-polymers},
  author = {H. Chakravorty and A. C. C. Coolen and D. Sherrington},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0206277},
  year   = {2007}
}

备注

21 pages, 7 figures