受酶促力偶极作用的染色体中的主动动力学与空间相干运动
软凝聚态物质
2019-04-03 v1 统计力学
生物大分子
摘要
受近期染色体动力学实验的启发，我们提出了一个关于柔性聚合物与一组类马达酶之间相互作用的精确可解模型。这些酶可以结合并解离到聚合物的特定位点，结合时会对两个相邻单体产生偶极力。我们研究了聚合物由此产生的非平衡动力学，发现单体的运动具有染色体位点实验中观察到的若干性质：次扩散的均方位移以及相关运动区域的出现。我们还确定了单体的速度自相关函数，发现其 underlying 随机过程并非分数布朗运动。最后，我们表明主动力使聚合物膨胀的量在大型聚合物时趋于恒定。
引用
@article{arxiv.1811.09212,
title = {Active dynamics and spatially coherent motion in chromosomes subject to enzymatic force dipoles},
author = {Stefanie Put and Takahiro Sakaue and Carlo Vanderzande},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.09212},
year = {2019}
}