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具偶极活性力的聚合物链及其与染色质空间组织的联系

软凝聚态物质 2023-03-15 v2 生物物理

摘要

活细胞是一种活性环境,其中染色质的组织与动力学受到不同形式活性的影响。光学实验报道,基因位点呈现亚扩散动力学,且染色质纤维在微米尺度区域上表现为相干。利用具偶极活性力的珠-簧聚合物链,我们研究基因位点的亚扩散运动如何产生染色质的大尺度相干运动。我们表明,在存在伸展(收缩)活性时,与无偶极力情形相比,基因位点的动力学变快(变慢),空间关联长度增大(减小)。因此,两种偶极活性力都改变了链的弹性。有趣的是,在我们的模型中,此类偶极活性链的动力学与组织很大程度上不同于具有重整化弹性的被动链。

关键词

引用

@article{arxiv.2202.06529,
  title  = {A Polymer Chain with Dipolar Active Forces in Connection to Spatial Organization of Chromatin},
  author = {Subhasish Chaki and Ligesh Theeyancheri and Rajarshi Chakrabarti},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2202.06529},
  year   = {2023}
}