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力学化学酶与蛋白质机器作为流体动力学力偶极子:活性二聚体模型

软凝聚态物质 2021-12-28 v3

摘要

力学化学活性酶在每个周转周期内改变其形状。因此,它们在周围溶剂中诱导出循环流动,并表现为振荡的流体动力学力偶极子。由于酶集体产生的非平衡涨落流,溶液中及其中被动粒子的混合与扩散预期会得到增强。在此,我们在力学化学酶的最小活性二聚体模型中研究此类力偶极子的强度与统计性质。在该模型框架下,推导了在快速旋转扩散下溶液与脂质双分子层中流体动力学集体效应的新估计,并检验了已有的实验与计算数据。

关键词

引用

@article{arxiv.2003.02574,
  title  = {Mechanochemical enzymes and protein machines as hydrodynamic force dipoles: The active dimer model},
  author = {Yuto Hosaka and Shigeyuki Komura and Alexander S. Mikhailov},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2003.02574},
  year   = {2021}
}

备注

16 pages, 7 figures