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酶的扩散:涨落诱导的流体动力学耦合的作用

软凝聚态物质 2017-11-22 v3 统计力学

摘要

使用由两种流体动力学耦合的亚基构成的不对称哑铃简单通用模型,研究了模块化大分子(如酶)的构象涨落对其扩散性质的影响。结果表明,平衡涨落可导致内部与外部自由度之间的相互作用,并对总体扩散系数产生负贡献。考虑到该模型酶探索一个机械化学循环,我们展示了底物结合与解离如何影响其内部涨落,以及这如何导致分子总体扩散系数的增强。这些理论预测与最近利用荧光相关光谱在稀释条件下测量酶扩散的实验结果成功吻合。

关键词

引用

@article{arxiv.1611.02580,
  title  = {Diffusion of an Enzyme: the Role of Fluctuation-Induced Hydrodynamic Coupling},
  author = {Pierre Illien and Tunrayo Adeleke-Larodo and Ramin Golestanian},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1611.02580},
  year   = {2017}
}