遗传演进与癌症等待时间
种群与进化
2011-11-10 v1 定量方法
摘要
癌症是由扰乱细胞正常合作行为的遗传改变引起的。近期对癌细胞的高通量基因组研究表明，癌症的突变图谱十分复杂，且单个癌症可能通过多达20个不同癌症相关基因的突变演化而来。我们利用 Sjoblom 等人 (2006) 公布的数据，建立了一个新的结直肠癌体细胞演化的数学模型。我们采用 Wright-Fisher 过程来探索该演化过程的基本参数，并推导出癌症表型预期等待时间的解析近似。我们的结果突显了选择相对于危险细胞群体大小和突变率的相对重要性。该模型预测，如果每次突变的平均选择优势在1%的数量级，则在正常突变率下即可产生观察到的癌症基因组遗传多样性。由遗传不稳定性导致的突变率增加，将允许在肿瘤发生期间存在更小的选择优势。因此，癌症进展的复杂性可以理解为多个连续突变的结果，每个突变对净细胞生长具有相对较小但正向的效应。
引用
@article{arxiv.0707.3770,
title = {Genetic progression and the waiting time to cancer},
author = {Niko Beerenwinkel and Tibor Antal and David Dingli and Arne Traulsen and Kenneth W. Kinzler and Victor E. Velculescu and Bert Vogelstein and Martin A. Nowak},
journal= {arXiv preprint arXiv:0707.3770},
year = {2011}
}
备注
Details available as supplementary material at http://www.people.fas.harvard.edu/~antal/publications.html