肿瘤进展过程中驱动突变和乘客突变的积累
种群与进化
2010-11-18 v1
摘要
目前，全球正在进行大规模癌症基因组测序工作。尽管这些研究产生的新数据具有启发性，但如何将其与流行病学和临床观察结果相协调仍是一个重大挑战。在本研究中，我们提供了一个新颖的数学模型，开始应对这一挑战。我们将肿瘤建模为一个离散时间分支过程，该过程始于单个驱动突变，并随着每个新驱动突变导致克隆扩增率略有增加而进行。利用该模型，我们观察到肿瘤发展速度的巨大差异——这为理解流行病学家和临床医生观察到的肿瘤大小和发展时间的异质性提供了依据。此外，该模型提供了一个简单的公式，用于计算驱动突变数量与肿瘤中总突变数量的函数关系。最后，当应用于最近的实验数据时，该模型使我们能够首次计算出人类肿瘤原位中典型体细胞突变提供的实际选择优势。这种选择优势出奇地小，为 0.005 ± 0.0005，这对实验癌症研究具有重大意义。
引用
@article{arxiv.0912.1627,
title = {Accumulation of driver and passenger mutations during tumor progression},
author = {Ivana Bozic and Tibor Antal and Hisashi Ohtsuki and Hannah Carter and Dewey Kim and Sining Chen and Rachel Karchin and Kenneth W. Kinzler and Bert Vogelstein and Martin A. Nowak},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.1627},
year = {2010}
}