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癌症中突变驱动通路的发现:模型与算法

基因组学 2016-04-06 v1

摘要

人类癌症的发病机制仍知之甚少。随着高通量测序技术的快速发展,已产生海量癌症基因组学数据。解读这些数据给计算生物学家带来了巨大机遇与挑战。其中的一个关键挑战是将驱动突变、驱动基因以及驱动通路与乘客突变等区分开来。基因突变的互斥性(每个患者在基因集中至多有一个突变)已在多种癌症类型中被观察到,因此被用作驱动基因集或驱动通路的重要性质。本文旨在综述用于发现癌症中驱动通路或模块的计算模型与算法的最新进展,重点关注基于互斥性的那些。

关键词

引用

@article{arxiv.1604.01298,
  title  = {The Discovery of Mutated Driver Pathways in Cancer: Models and Algorithms},
  author = {Junhua Zhang and Shihua Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1604.01298},
  year   = {2016}
}

备注

11 pages, 4 figures