利用整合网络方法理解癌症基因组中的基因组改变
基因组学
2014-09-12 v1 分子网络
摘要
近年来，癌症基因组测序及其他癌症基因组的高通量研究产生了许多引人注目的发现。在本综述中，讨论了新型基因组改变机制，如染色体碎裂（染色体危机）和 Kataegis（突变风暴），及其对癌症的影响。基因组改变推动了癌症基因组的进化。因此，文中评论了癌症克隆进化与癌症干细胞之间的关系。癌症生物学的关键问题在于这些基因组改变如何在生物功能的背景下支持癌症的发展和转移。迄今为止，诸如通路分析等努力已提高了对基因突变和 DNA 拷贝数变异对癌症发展、进展和转移的功能性贡献的理解。然而，已知通路仅对应于一小部分（可能为 5-10%）的体细胞突变和拷贝数改变的基因。为了全面理解这些基因组改变在癌症中的功能，本文提出并讨论了一种整合网络框架。最后，评论了利用整合网络方法研究癌症组学数据所面临的挑战与方向。
引用
@article{arxiv.1409.3263,
title = {Understanding genomic alterations in cancer genomes using an integrative network approach},
author = {Edwin Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1409.3263},
year = {2014}
}
备注
2 figs, more related papers at http://www.cancer-systemsbiology.org. appears in Cancer Letter, 2013