小型零一反应网络等价性的判定
分子网络
2026-02-03 v2
摘要
零一反应网络在细胞信号传导中至关重要，确定此类网络的等价性代表着化学反应网络研究中一个基础性计算挑战。本文提出了一种高效的方法，用于识别零一网络的等价性。其有效性源于一套针对判断零一网络所导出的稳态理想等价性的准则，这些准则有效地降低了Gröbner基计算的计算成本。实验结果表明，我们提出的方法能够在可行的时间范围内成功地将超过三百万个网络按其等价性进行分类。此外，我们对于两个重要的二次零一网络类(3维、3种物种、6个反应;4维、4种物种、5个反应)的计算结果显示，它们对于一般速率常数的正稳态无解，这意味着这些小型网络在一般情况下既不表现出多稳态性，也不表现出周期轨道。
引用
@article{arxiv.2503.00008,
title = {Determining the Equivalence of Small Zero-one Reaction Networks},
author = {Yue Jiao and Xiaoxian Tang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.00008},
year = {2026}
}