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判定反应网络是否多稳态的方法综述

动力系统 2015-08-21 v3 分子网络

摘要

哪些反应网络在采用质量作用动力学时具有多重稳态的能力?这一问题尚无完整答案,但在过去 40 年中,已发展出多种准则,可在特定情况下回答该问题。本文综述了这些进展,重点介绍了近期将某一网络的多稳态能力与另一网络相关联的结果。在后一种情形下,我们考虑嵌入于更大网络 GG 中的网络 NN,这意味着 NN 是通过从 GG 中移除部分化学物种和反应子集而得到的。这种嵌入关系是子网络关系的显著推广。对于任意网络,若 NN 嵌入于 GG,则 NN 的稳态提升至 GG 这一结论并不成立。尽管如此,该结论对某些类别的网络确实成立;全开放网络(fully open networks)便是此类之一。这激发了对嵌入极小多稳态网络的寻找:即那些允许多重稳态,但其任何真嵌入网络均不允许多重稳态的网络。我们展示了关于此类极小网络的结果,包括构造无限族此类网络的若干新方案。

关键词

引用

@article{arxiv.1412.5257,
  title  = {A survey of methods for deciding whether a reaction network is multistationary},
  author = {Badal Joshi and Anne Shiu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1412.5257},
  year   = {2015}
}