绝对浓度鲁棒性：代数与几何
代数几何
2024-11-14 v3 动力系统
分子网络
摘要
受生物系统如何在变化环境中维持稳态这一问题的启发，Shinar和Feinberg于2010年引入了绝对浓度鲁棒性（ACR）的概念。如果一个生化系统中某个物种的稳态值不依赖于初始条件，则该系统在该物种上表现出ACR。因此，具有ACR的系统可以在环境变化时维持一个物种的恒定水平。尽管近年来对ACR产生了极大兴趣，但以下基本问题仍然悬而未决：如何快速确定一个给定的生化系统是否具有ACR？尽管已经提出了各种方法来解决这个问题，但我们证明它们是不完备的。因此，我们提出了利用计算代数来判断ACR的新方法。我们在几个生化信号网络上展示了我们的结果。
引用
@article{arxiv.2401.00078,
title = {Absolute concentration robustness: Algebra and geometry},
author = {Luis David García Puente and Elizabeth Gross and Heather A Harrington and Matthew Johnston and Nicolette Meshkat and Mercedes Pérez Millán and Anne Shiu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2401.00078},
year = {2024}
}
备注
Proof in Section 5 edited, in response to reviewer comments