论（生物）化学反应网络中反应与复合物之间的关系
分子网络
2012-03-28 v1 经典分析与常微分方程
动力系统
摘要
生物化学系统的鲁棒性已成为系统生物学的核心问题之一，尽管其多面性极难被形式化地刻画。正常系统功能的维持不仅取决于底层相互关联组分的化学计量学，还取决于众多的动力学参数。在通量耦合分析中获得的守恒通量比，以及在化学反应网络理论中推导出的守恒复合物比，可以表征系统在稳态下的鲁棒性质。然而，描述这些不变量的现有形式体系并未提供完整的刻画，因为它们要么仅关注以通量为中心的视角，要么仅关注以浓度为中心的视角。在此，我们发展了一个结合两种视角的全新数学框架，从而克服了经典方法的局限性。我们的统一框架将有助于分析具有重要生物学意义的系统性质。
引用
@article{arxiv.1203.5932,
title = {On the relation between reactions and complexes of (bio)chemical reaction networks},
author = {Jost Neigenfind and Sergio Grimbs and Zoran Nikoloski},
journal= {arXiv preprint arXiv:1203.5932},
year = {2012}
}