代谢胰岛素信号的反应网络分析
分子网络
2022-09-14 v3 代数几何
摘要
绝对浓度鲁棒性(ACR)与协调性是化学反应网络理论中鲁棒性与稳定性学说的全新概念。本文基于近期反应网络分解的进展，将Shinar与Feinberg的反应网络分析方法推广至胰岛素信号系统。我们证明了该含20个物种、35个复合体与35个反应的网络是协调的，意味着在其每个化学计量相容类中至多存在一个正平衡态。我们获得了该系统最精细的独立分解，由10个子网络构成；对其粗化后揭示出3个不仅在功能上而且在结构上都重要的子网络。利用该网络面向缺陷的粗化，我们提出了一种确定整个网络正平衡态的方法。我们的分析还表明，该系统在8个物种上具有ACR，且均来自零缺陷子网络。有趣的是，我们证明对于一组速率常数，受胰岛素调节的葡萄糖转运蛋白GLUT4(在葡萄糖能量代谢中十分重要)具有稳定的ACR。
引用
@article{arxiv.2204.04614,
title = {Reaction Network Analysis of Metabolic Insulin Signaling},
author = {Patrick Vincent N. Lubenia and Eduardo R. Mendoza and Angelyn R. Lao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2204.04614},
year = {2022}
}
备注
34 pages, 1 figure