基于亏缺的生化反应系统正平衡态参数化方法
动力系统
2018-05-24 v1 代数几何
摘要
我们给出了保证广义质量作用系统正平衡态集合可参数化的条件。我们的主要结果表明：(i) 若底层广义化学反应网络的有效亏缺为零，则正平衡态集合与参数化的复平衡平衡态集合重合；(ii) 若网络弱可逆且动力学亏缺为零，则平衡态集合非空且具有正的、通常为有理函数的参数化。通过网络平移方法，我们将结果应用于生化文献中研究的经典质量作用系统，包括 EnvZ-OmpR 和穿梭型 WNT 信号通路。正如我们在 EnvZ-OmpR 通路中所展示的，(广义)质量作用系统正平衡态集合的参数化通常是研究多稳态性的前提，并可简便地检验绝对浓度鲁棒性(ACR)的发生。
引用
@article{arxiv.1805.09295,
title = {A deficiency-based approach to parametrizing positive equilibria of biochemical reaction systems},
author = {Matthew D. Johnston and Stefan Müller and Casian Pantea},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.09295},
year = {2018}
}
备注
23 pages, 0 figures