折叠模型蛋白中的热力学重要接触
统计力学
2009-10-31 v1 q-bio
摘要
我们引入了一种量表——熵抗性，来衡量折叠过渡中氨基酸之间接触的热力学重要性。通过该量表，我们发现，对模型蛋白进行一次平衡计算机模拟运行即可选择出导致折叠过渡处比热峰产生的接触子集。为了说明该方法，我们在 46 肽模型中识别出热力学重要的接触。我们表明，约有 50% 的所有接触负责产生折叠过渡温度处比热峰的尖锐峰值，而其余 50% 的接触不影响比热。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0012288,
title = {Thermodynamically Important Contacts in Folding of Model Proteins},
author = {Antonio Scala and Nikolay V. Dokholyan and Sergey V. Buldyrev and H. Eugene Stanley},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0012288},
year = {2009}
}
备注
5 pages, 5 figures; to be published in PRE