蛋白质折叠的热容
凝聚态物理
2009-11-07 v1 q-bio
摘要
我们构建了一个单域蛋白质的哈密顿量,其中接触焓和链熵随着本征接触数的线性变化。通过将水分子建模为围绕未折叠表面的有序偶极子,包含了蛋白质展开时的水化效应,其中包含有“类冰”水壳的表面由有效场指向水分子偶极子。还引入了水分子之间的分子间相互作用。该模型的热容表现出小型球状蛋白质的常见特征:分别对应冷变性和温变性,出现两个峰。通过引入振动模式,我们能够获得与实验结果的定量良好一致。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0102329,
title = {Heat Capacity of Protein Folding},
author = {Audun Bakk and Johan S. Hoye and Alex Hansen},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0102329},
year = {2009}
}
备注
14 pages, LaTex, 4 figures